Một, Lá
Khi lá nở ra, lá của phượng đan không có sự phân nhánh; lá của mẫu đơn thường phân thành ba nhánh.
Hai, Rễ
Rễ của phượng đan có rễ thịt rất rõ ràng, và hệ thống rễ không phát triển mạnh; rễ của mẫu đơn phát triển tốt hơn, có nhiều rễ con. Số lượng rễ nhiều hơn là mẫu đơn.
Ba, Cành
Cành của phượng đan khá ít, dài và khá thẳng, khoảng cách giữa các chồi tương đối dài, đến mùa thu thì đường kính cành sẽ trở nên khá rỗng và dễ bị lột vỏ; cành của mẫu đơn có nhiều, không thẳng lắm và có hiện tượng hơi cong, khoảng cách giữa các chồi rất ngắn, cành không dễ bị lột vỏ và khá mịn màng.
Bốn, Hoa
Phượng đan có hoa đơn màu trắng; hoa mẫu đơn lớn, với màu sắc khác nhau tùy thuộc vào giống, chẳng hạn như trắng, hồng, vàng, v.v.
Năm, Hạt
Phượng đan sẽ kết hạt, tức là sẽ ra hoa kết quả; mẫu đơn thường không kết hạt, hoa nở càng đẹp thì càng không kết hạt, tức là chỉ ra hoa mà không kết quả.